Utilització de xarxa Ethernet per a càlculs. Cluster de Computació

Utilització de xarxa Ethernet per a càlculs. Cluster de Computació - IUII

Cluster de Computació - IUII

Utilització de xarxa Ethernet per a càlculs

Per defecte les llibreries paral·leles utilitzen la xarxa Infiniband per al pas de missatges; per a utilitzar la xarxa Ethernet en els càlculs paral·lels és necessari tenir en compte diversos aspectes.

Intel MPI

En cas d'Intel MPI ho podem definir en el moment d'execució afegint una opció a mpiexec.

$ mpiexec -genv I_MPI_DEVICE shm -n <# of processes> ./myprog

Podem triar entre els següents "Fabriques":

I_MPI_DEVICE values Supported fabric
sock TCP/Ethernet*/sockets
shm Shared memory only (no sockets)
ssm TCP + shared memory (for SMP clusters connected via Ethernet*)
rdma[:] InfiniBand*, Myrinet* (via specified DAPL* provider)
rdssm[:] TCP + shared memory + DAPL* (for SMP clusters connected via RDMA-capable fabrics)

MVAPICH 1/2

No suporten Ethernet de 1Gb però shared memory per a alguns funcions de MPI que poden ser desactivats durant l'execució.

És a dir que l'operacions dins d'un mateix node estan optimitzades.

OpenMPI

En openmpi cal activar el mòdul btl usant mpirun de la següent manera:

$ mpirun -gmca btl tcp,self ./el meu_programa

També és possible posar el paràmetre sm si la comunicació passa entre de la mateixa màquina:

$ mpirun -gmca btl sm,tcp,self ./el meu_programa